Форум » Общие вопросы » Конкурс "Знаешь ли ты аскомицеты?"; посвящено 8 марта » Ответить
Конкурс "Знаешь ли ты аскомицеты?"; посвящено 8 марта
SAE: Уважаемые конкурсанты-номинанты! Начинается четвёртый, заключительный этап конкурса! Обсуждаем один единственный вопрос - как лучше разместить материалы, предложенные на конкурс (фото грибов и фото микропризнаков) по аскомицетам на сайте? Обсуждение предлагаемого вопроса - открытое. Срок - до 2 мая - как и просили некоторые участники. Ответы на вопросы первого этапа прислали 18 человек, что точно соответствует числу видов. Во втором этапе получены ответы от 10-и участников. Нерешительных просят подтягиваться - помните - главное - не победа, а участие! На третьем этапе получены ответы от 4-х участников. Заявок на участие - семь. Ещё три человек обещали прислать свои ответы У нас сегодня начинается новый конкурс - "Знаешь ли ты аскомицеты?" Правила конкурса. Конкурс проводится в два этапа. 1. На первом этапе Вам нужно определить 18 видов аскомицетов, рассматривая их характерные фотографии. Не пугайтесь, это не такая уж сложная задача. 1.1. Вам предлагаются фотографии аскомицетов, обозначенные буквами от A до R, и список видов, пронумерованный числами от 1 до 18. 1.2. Ваша задача, используя Ваши знания аскомицетов, грибные сайты (ГКО – в первую очередь) и форумы, помощь Интернета, наконец, дать список ответов в очень простом виде – A – 15; B – 4; … и так далее. 1.3. Ответы следует присылать по эл. почте или через личные сообщения организатору конкурса, т.е. мне. 1.4. Подведение итогов первого этапа состоится через неделю, а именно - в ночь с 14 на 15 марта 2009 г. 1.5. Номинации: - специалист-эксперт по аскомицетам; - консультант по аскомицетам; - любитель аскомицетов. 1.6. После подведения итогов и объявления призёров первого этапа начнётся собственно второй этап конкурса. Правила второго этапа 2. На втором этапе конкурса Вы сопоставляете фотографии уже известных Вам аскомицетов с микрофотографиями спор, асков, парафиз и эксципула. 2.1. Вам предлагаются фотографии аскомицетов, обозначенные буквами от A до R, и блоки микрофотографий, выполненных при различных увеличениях, пронумерованные числами от 1 до 18. 2.2. Чтобы не превращать конкурс в практически неразрешимую задачу, все фотографии сгруппированы в пять блоков. 2.3. Ваша задача, используя Ваши знания аскомицетов, грибные сайты (ГКО – в первую очередь) и форумы, помощь Интернета, наконец, дать список ответов в очень простом виде – A – 15; B – 4; … и так далее. Ответы можно группировать по блокам. 2.4. Дополнительные баллы можно получить, указывая в своих ответах характерные признаки спор, асков, парафиз и эксципула рассматриваемых видов грибов. 2.5. Ответы следует присылать по эл. почте или через личные сообщения. 2.6. Во втором этапе могут принять участие лица, НЕ участвовавшие в первом этапе. 2.6. Подведение итогов второго этапа состоится через неделю, а именно – в ночь с 21 на 22 марта 2009 г. 2.7. Номинации: - специалист-эксперт по аскомицетам; - консультант по аскомицетам; - любитель аскомицетов; - ученик любителя (без стипендии) - по просьбе трудящихся. Третий этап конкурса, посвящённый DNA, стартует сегодня. Подведение итогов - в ночь с 31 марта на 1-е апреля! Правила: ответьте в личку на несколько вопросов и получите одну из номинаций. - генетик-шифровальщик; генетик-дешифровальщик; - генетик-любитель, - ученик генетика. Вопросы на 11 странице темы http://mycoweb.borda.ru/?1-0-0-00000517-000-200-0#077 Список видов: 1. Aleuria aurantia – Алеврия оранжевая 2. Ascocoryne cylichnium - Аскокорине блюдцевидная 3. Ascocoryne sarcoides – Аскокорине мясная 4. Bulgaria inquinans – Булгария пачкающая 5. Choiromyces meandriformis – Трюфель белый 6. Cordyceps militaris - Кордицепс воинственный 7. Encoelia furfuracea - Энцелия шелушистая 8. Gyromitra esculenta – Строчок обыкновенный 9. Gyromitra gigas – Строчок гигантский 10. Gyromitra infula – Строчок осенний 11. Helvella acetabula – Ацетабула обыкновенная 12. Leotia lubrica – Леотия студенистая Cudonia_circinans - Кудония закрученная (провокация) 13. Otidea onotica – Отидея ослиная 14. Peziza micropus – Пецица микропус 15. Peziza varia – Пецица изменчивая 16. Peziza violacea – Пецица фиолетовая 17. Sarcoscypha austriaca - Саркосцифа австрийская Блок №1 Object F - Ascocoryne cylichnium - Аскокорине блюдцевидная (0 ошибок) Object P - Ascocoryne sarcoides – Аскокорине мясная (1 ошибка) Object G - Encoelia furfuracea - Энцелия шелушистая (0 ошибок) ---------------------------------- Блок№2 Object O - Peziza micropus – Пецица микропус (6 ошибок) Object H - Peziza varia – Пецица изменчивая (8 ошибок) Object I - Peziza violacea №1 – Пецица фиолетовая №1 (2 ошибки) Object Q - Peziza violacea №2 – Пецица фиолетовая №2 (10 ошибок) ----------------------- Блок№3 Object N - Bulgaria inquinans – Булгария пачкающая (0 ошибок) Object J - Choiromyces meandriformis – Трюфель белый (0 ошибок) Object E - Cordyceps militaris - Кордицепс воинственный (0 ошибок) Object K - Cudonia_circinans - Кудония закрученная (15 ошибок) ---------------------------- Блок №4 Object D - Gyromitra esculenta – Строчок обыкновенный (0 ошибок) Object C - Gyromitra gigas – Строчок гигантский (0 ошибок) Object L - Gyromitra infula – Строчок осенний (0 ошибок) ----------------------- Блок №5 Object B - Aleuria aurantia – Алеврия оранжевая (0 ошибок) Object R - Helvella acetabula – Ацетабула обыкновенная (0 ошибок) Object A - Otidea onotica – Отидея ослиная (3 ошибки) Object M - Sarcoscypha austriaca - Саркосцифа австрийская (0 ошибок) Успехов всем! Микрофотографии расположены на странице 7 ОТВЕТЫ ТОЛЬКО В ЛИЧКУ ИЛИ ПО ЭЛ, ПОЧТЕ! (SAE, извини, это я поставила, ariona, чтобы акцентировать внимание)
Wilhelm K.: Все звание .......мне обеспечено.! Ответил в "ёлочку на все вопросы 3-е этапа!
SAE: Получены великолепные ответы от четырёх участников. Остаются две проблемы - хотелось бы, чтобы все из участников прислали ответы на бонусный вопрос (пока - только один участник). Второе - хотелось бы большего. В смысле - количества участников.
Лидия Бам: SAE А можно только на бонусный ответить?переписывать статьи из учебников не интересно..
Wilhelm K.: Лидия Бам пишет: А можно только на бонусный ответить?переписывать статьи из учебников не интересно А мне было интересно! Жалко не понимаю ,смысла бонусного вопроса? Что определить ?Где взять?
Grey:
kut: Не могу , потому что не знаю ответа на главный - бонусный - вопрос.
SAE: Осталось потерпеть всего два часа.
SAE: Ну что вам сказать, друзья, по поводу третьего этапа?… Мыслей о его проведении у меня не было, пока вы сами мне её не подсказали. kut пишет: надеюсь вы не приобретёте секвенатор и таким образом не организуете 3-ий этап конкурса! Тут-то и пришла мысль пошутить по этому поводу, тем более, что стало известно, что в Америке даже дети пользуются секвенаторами. http://www.cbio.ru/v5/modules/news/article.php?storyid=416 Давайте вспомним вопросы конкурса http://mycoweb.borda.ru/?1-0-0-00000517-000-200-0#077 О том, что конкурс шуточный, свидетельствовала дата подведения итогов – накануне первого апреля. Однако полученные ответы показали всю серьёзность отношения участников к заданной теме. Судите сами по ответам, которые прислал Grey. "1. Что такое - Ц, А, Т, Г? Названия нуклеотидов представляют собой аббревиатуры в виде стандартных трёх- или четырёхбуквенных кодов. Если аббревиатура начинается со строчной буквы «д» (англ. d), значит подразумевается дезоксирибонуклеотид; отсутствие буквы «д» означает рибонуклеотид. Если аббревиатура начинается со строчной буквы «ц» (англ. c), значит речь идёт о циклической форме нуклеотида (например, цАМФ). Первая прописная буква аббревиатуры указывает на конкретное азотистое основание или группу возможных нуклеиновых оснований, вторая буква — на количество остатков фосфорной кислоты в структуре (М — моно-, Д — ди-, Т — три-), а третья прописная буква — всегда буква Ф («-фосфат»; англ. P). Латинские и русские коды для нуклеиновых оснований: A — А: Аденин; G — Г: Гуанин; C — Ц: Цитозин; T — Т: Тимин (5-метилурацил), не встречается в РНК, занимает место урацила в ДНК; U — У: Урацил, не встречается в ДНК, занимает место тимина в РНК. Общепринятые буквенные коды для обозначения нуклеотидных оснований соответствуют номенклатуре, принятой Международным союзом теоретической и прикладной химии (International Union of Pure and Applied Chemistry, сокращённо — англ. IUPAC, русск. ИЮПАК) и Международным союзом биохимии и молекулярной биологии (International Union of Biochemistry and Molecular Biology, сокращённо — англ. IUBMB). Если при секвенировании последовательности ДНК или РНК возникает сомнение в точности определения того или иного нуклеотида, помимо пяти основных (A, C, T, G, U), используют другие буквы латинского алфавита в зависимости от того, какие наиболее вероятные нуклеотиды могут находиться в данной позиции последовательности. 2. Что такое полинуклеотид? ПОЛИНУКЛЕОТИД (polynucleotide) - - линейная последовательность дезоксирибонуклеотидов в ДНК или рибонуклеотидов в РНК, в которой 31-углерод сахара пентозы одного нуклеотида связан с 51-углеродом сахара пентозы соседнего нуклеотида через фосфатную группу (фосфодиэфирная связь). Обычно П. состоит из 20 и более нуклеотидов 3. Что такое геном? Геном — совокупность всех генов организма; его полный хромосомный набор. Термин «геном» был предложен Гансом Винклером в 1920 г. для описания совокупности генов, заключённых в гаплоидном наборе хромосом организмов одного биологического вида. Первоначальный смысл этого термина указывал на то, что понятие генома в отличие от генотипа является генетической характеристикой вида в целом, а не отдельной особи. С развитием молекулярной генетики значение данного термина изменилось. Известно, что ДНК, которая является носителем генетической информации у большинства организмов и, следовательно, составляет основу генома, включает в себя не только гены в современном смысле этого слова. Большая часть ДНК эукариотических клеток представлена некодирующими («избыточными») последовательностями нуклеотидов, которые не заключают в себе информации о белках и РНК. 4. Зачем его нужно изучать? Государственные национальные программы по изучению генов человека существуют во многих странах. Это, если хотите, вопрос престижа страны. Но вместе с тем в последние лет пять на мировом рынке биотехнологий происходят принципиальные структурные изменения, быстро и верно превращающие молекулярную генетику из чисто академической науки в перспективный и высокодоходный бизнес. А последние два года ознаменовались настоящим бумом вложением огромных средств транснациональных фармакологических компаний в поиск и расшифровку человеческих генов, и в первую очередь генов болезней человека. В результате уже создано несколько так называемых геномных компаний, крупнейшие из которых "Myriad Genetics", "Incyte Рhаrmaceuticals", "Newman Genome" существуют всего от двух до четырех лет и имеют довольно неплохой для столь юного возраста заявленный капитал от 100 до 160 млн.долларов. При этом размеры инвестиций в них, сделанных такими фармакологическими гигантами, как "Johnson & Johnson", "Вауег", "Schering Plough", "SmithKline Beecham" и некоторыми другими, как правило, остаются закрытой информацией. 5. Как это можно сделать? Методы расшифровки нуклеотидной последовательности нуклеиновых кислот в отечественной литературе принято называть методами секвенирования. Еще в 50-е годы прошлого века были разработаны методы, позволяющие определять последовательность аминокислот в полипептидной цепи. Теоретически это несложно, поскольку все аминокислоты, встречающиеся в природных белках, имеют разные свойства. Поэтому, когда был расшифрован генетический код, появилась возможность восстанавливать нуклеотидную последовательность транскрибируемой ДНК по аминокислотной последовательности соответствующего белка. Однако, генетический код является вырожденным. Следовательно, первичная структура ДНК, полученная на основе анализа последовательности аминокислот, не является однозначной. Кроме того, для эукариот таким способом можно восстановить лишь нуклеотидный состав экзонов, тогда как информация о составе интронов теряется в результате сплайсинга." Я не ожидал столь развёрнутого ответа. Другие участники были более сдержаны. Ким "1) Т - тимин, тимидин, А - аденин, аденозин, Г - гуанин, гуанозин, Ц - цитозин, цитидин. (азотистые основания - нуклеотиды). 2) полинуклеотид - это строго последовательная цепочка из остатков нуклеотидов, связанных фосфодиэфирной связью. Синоним - нуклеиновая кислота. 3) геном - это совокупность всех генов организма. 4) затем, чтобы знать какие из белков могут образовываться в данном организме. А вот уж функции белков расписывать не буду 5) Путем секвенирования. Рассказывать о типах?" Wilhelm K. "1)Ц, А, Т, Г Ц--цитозин А--аденин Т--тимин Г--гуанин Строение ДНК, название молекул, присоединенных к полимерной цепи. 2)Polynucleotide-цепь связанных между собой нуклеотидов ,составляющих РНК унд ДНК. 3)Геном - прежде всего портал ФРГ в Инете. но еще и совокупность всех генов в организма, полный хромосомный набор. 4)Для тщательного иследования: гормоны,цитология,микробиология,гены,ДНК. 5)Путем изучения ДНК гаплоидного набора хромосом , также каждого из внехромосомных генетических элементов." Ir4ik "1) Ц-Цитозин(Cytosine)-азотистое основание, входящее в состав ДНК и РНК, A-Аденин(Аdenine) - одно из азотсодержащих оснований , присутствующее в ДНК и РНК, комплементарное тимину. Т-Тимин(Thymine)- азотистое основание, входящее в состав ДНК. Г-Гуанин(Guanine)- азотсодержащее оснований , присутствующее в ДНК и РНК, комплементарное цитозину. 2) Линейный полимер, состоящий из 20 и более нуклеотидов, соединенных друг с другом фосфодиэфирными связями. Полинуклеотидами являются, например, молекулы ДНК и РНК. 3) Genome-совокупность генов гаплоидного набора хромосом организма- просто набор генов в ДНК - весь генетический материал какого-либо организма, включая содержащиеся в хромосомах гены - 23 хромосомы. 4) Дж.Уотсон, сказал: "Мы привыкли думать, что наша судьба предначертана звездами. Теперь мы знаем, в существенной степени наша судьба - в наших генах". Создание генетического паспорта. Генетическое тестирование, профилактические меры, снижающие риск заболеваний, и генная терапия до 25 наследственных заболеваний. В перспективе - появление лекарств от диабета, гипертонии и других заболеваний, разработанные на основе геномной информации, терапия рака, прицельно направленная на свойства раковых клеток определенных опухолей. 5) Первичная структура молекулы ДНК генома анализируется с помощью секвенирования, т.е. методов, позволяющих определить точное взаиморасположение пар нуклеотидов в спирали ДНК. А вообще спасибо - много интересного узнала и вспомнила." Лидия Бам "1. Что такое - Ц, А, Т, Г? Вообще это буквы кириллицы, нашего алфавита. Применительно к генетике это - четыре азотистых основания - гуанин (G), аденин (A) , тимин (T) и цитозин (C), которые вместе с сахаром (дезоксирибозой) и фосфатной группой образуют нуклеотиды. Нуклеотиды - это своего рода блоки, составляющие цепь ДНК. 2 Что такое полинуклеотид? Полинуклеотид - полимерная молекула, составленная из нуклеотидов; основные полинуклеотиды – ДНК и РНК. 3. Что такое геном? Геном - совокупность всех генов организма; его полный хромосомный набор. 4. Зачем его нужно изучать? Изучать нужно все - даже иногда не зная зачем Геном -фундаментальный классификационный признак, своеобразный шифр всего живого. Если его изучить - можно практически сравняться с Богом. Ну не могу я серьезно и кратко отвечать на такие глобальные вопросы. 5. Как это можно сделать? Секвенирование ДНК Думаю что нет нужды копировать в ЛС кучу информации, лежащей в инете Еще раз спасибо за конкурсы." Бонусный вопрос – о результатах секвенирования ДНК – даже не предполагал какого-либо серьёзного подхода. И наш уважаемый alkov – специалист-генетик (и это не первоапрельская шутка) - рискнул ответить сразу на бонусный вопрос, причем, в "прямом эфире": "Это - великолепные наборы фломастеров, Made in China, все - по 1$". Ответил, конечно, неверно, но весело и задорно. Вторая версия: "Неужели настоящие деревянные цветные карандаши?" развеселила ещё больше. После такого первоапрельского подхода к первоапрельскому розыгрышу стали поступать ответы на бонусный вопрос. Ответы разные – и серьёзные, и шуточные. Ким – "Гадал-гадал, какому организму эти "штрихкоды" принадлежат, решил что одна "ослиная" а вторая грибная". Имелась в виду, очевидно, отидея ослиная. Ir4ik "Выбрать что-то из 17 объектов...это оч трудно. Пусть это будет Peziza micropus и нематода из неё." А вот серьёзные ответы. Правда, не совсем верные. Но это никоим образом не принижает достоинства наших конкурсантов. Grey "При перекодировке красно-сине-зеленых черточек карты генома и получения последовательностей типа GAA-TTT-GAG-CAG-GAT и так далее до 48 с последующей расшифровкой на сайте http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=Nucleotide&itool=toolbar получилось следующее: Маленькая фотография с одним геномом: Loligo bleekeri mitochondrial DNA Большая фотография с четырьмя геномами: Сверху вниз: 1.Streptomyces coelicolor 2.Mycobacterium tuberculosis 3.Loligo bleekeri mitochondrial DNA 4.Mycobacterium bovis BCG str.Pasteur В четвертом определении неуверен, может какой то подвох? Конечно же, все эти бактерии и микроорганизмы присутствуют на Ваших замечательных фотографиях!" Лидия Бам "Таксономисты и систематики описывают виды словесно — как выглядят, как живут, как размножаются и т. п. Представителя любого вида можно определить выделив в его митохондриальной ДНК стандартный для всего живого участок, секвенировать его (то есть определить последовательность нуклеотидов) и занести информацию в соответствующую базу данных, размещенную в интернете. Например – Это первый рисунок. Второй рисунок с помощью Bold Sistem показал, что это геном бабочки пестрокрылки Taxonomic Level Taxon Assignment Probability of Placement (%) phylum Arthropoda 100 class Insecta 100 order Diptera 100 family Tachinidae 100 genus Zygozenillia 100 species Zygozenillia Wood01 100 Не уверена, конечно, что второй рисунок правильно определился. Спасибо за конкурсы - интересно. Я вечером на неделю уезжаю, м.б. ответите в ЛС, правильно ли второй рисунок определен? А то умру от любопытства.. Думаю, мы попросим наших замечательных участников попозже рассказать нам, как они получили свои ответы. А вот исходный файл, правильный или нет, это другой вопрос… . Итоги. Grey и Лидия Бам заслужено получают первое место и почётное звание генетика-дешифровальщика. Второе место и почётное звание генетика-любителя получают Ким, Wilhelm K. и Ir4ik. Все остальные участники, которые имели неосторожность ввязаться в дискуссию на форуме, но не сумели отправить свои ответы, получают звание ученика генетика Трофима Денисовича. Приз - в студию http://www.cartoonstock.com/directory/d/dna_code_gifts.asp
ariona: SAE Если бы знала, что будет геном сов, то...Эх.. Трофим Денисович Ариона Поздравляю победителей!
SALAVAT: Да уж, можно я пока буду по макропризнакам, в крайнем случае по спорам пытаться определить Присоединяюсь к поздравлениям!
Ir4ik: SAE Спасибо!! Поздравления всем!
Ким: SAE, большое спасибо! Получилось очень весело и интересно! Grey и Лидия Бам, мои поздравления!
kut: Поздравляю победителей! Лет эдак через двадцать SAE именно с этого третьего этапа начнёт конкурс (пропустив первый и второй за неактуальностью), а что будет на следующих этапах, подумать страшно (моделирование внешнего вида грибов по ДНК - например, какие части ядерной ДНК опенка надо поменять, чтобы тот превратился в цилиндробазидиум или как-то так)! Время пошло...
SALAVAT: kut Надеюсь, я до этого не доживу
Ким: SALAVAT, сплюнь! Вдруг ты себе "моделятор" потом купишь и будешь забавляться, убирая и вставляя отдельные триплеты?
kut: SALAVAT, доживёте! И быть может, получите приз за лучший дизайн гриба!
ariona: Ким пишет: убирая и вставляя отдельные триплеты? Знать бы еще - куда...
Ким: ariona пишет: Знать бы еще - куда... В этом весь интерес!
coloboc: Фуф, хорошо, что я не засветился в форуме под третий конкурс. А то и менябы записали в ученики Трофима Денисовича. Всё что угодно, только не это ;). Вообще, была мысля послать шуточные ответы на вопросы, но времени на это не нашёл.
mvkarpov: Я думал, раз конкурс касается сумчатых, то приведённые "штрихкоды" не что иное, как геномы кенгуру, коалы, сморчков и строчков...
полная версия страницы